Ja - Nein.
Der Windows-Explorer kopiert nix auf den PPC, sondern veranlasst ActiveSync, das übertragen der Dateien zu übernehmen. Dabei werden voreingestellte Formate (in AS: Optionen.>Regeln.>Konvertierung) automatisch durch Konverter gejagt. Alle unbekannten Dateien unverändert auf dem PPC gespeichert. Billisoft tarnt hier wie so oft, was passiert.
Der Commander kopiert sozusagen "echt". Eine Einbindung von Filtern findet nicht statt und wird es m.W. auch nicht geben, da MS dann ja die Filter für die Office-Formate herausgeben müsste.