Hast Du denn die Daten genauso rüberkopiert wie wir, d.h. Ordner rechte Maustaste anklicken-kopieren und dann die Speicherkarte auswählen und mit rechter Maustaste Einfügen?
Wenn ja, dann mal irgendwoher einen anderen Cardreader probieren.
Wenn Nein, dann mal so probieren, denn es gibt einige Programme wie Windows Commander, die evtl. etwas länger brauchen, da diese direkt das geschriebene überprüfen. (Wobei ich jetzt nicht explizit weiß, ob W-Commander dies so macht...)