Hi Carsten,
jetzt hast Du mich doch noch dazu gebracht, alles nochmal selber durchzutesten! 
Ist das Tracking aktiviert (Beschriftung des Button lautet "GPS-Spur aufzeichnen" ) und ist der Ordner UserTracks weder auf der SD noch auf der FD vorhanden, wird dieser nach einem SoftReset auf der SD angelegt und es wird NICHT getrackt!
Beende ich GoPal und starte es wieder neu, ohne eine Einstellung geändert zu haben, fängt er in dem o.g. Ordner zu tracken an (also auf der SD).
Beende ich jetzt das Tracking ("GPS-Spur nicht aufzeichnen" ) und starte GoPal neu (ohne SR), wird nicht getrackt! Verschiebe ich diesen Ordner auf die FD und beende und starte GoPal (ohne Tracking), wird weiterhin nicht getrackt und auf der SD auch kein Ordner angelegt.
Jetzt das Tracking aktivieren (zur Erinnerung: der Ordner UserTracks ist auf der FD!), fängt er dort sofort mit dem Tracking an, ohne Neustart! Beende und starte ich GoPal, trackt er sofort weiter in '\My Flash Disk\UserTracks'.
Das Beenden vom Tracking schließt die Datei ab und er trackt nicht mehr weiter. Und während auf der FD dieser Ordner existierte, hat er keinen zusätzlichen auf der SD-Karte angelegt!
Getestet wurde unter PE3.0-5134 mit dem org. Skin. 